燃气锅炉的运行通常是指一台新燃气锅炉在安装后，在进行烘炉、煮炉、点火升温、并炉供热、正常运行、停炉与停炉保养等一系列内容的总称。燃烧调节、参数调节及运行中的技术操作则基本相同。热水采暖系统投入起动前，应对系统进行冲洗。新安装的热水采暖系统，很难避免系统中落入杂物。为了预防热水系统运行过程中这些杂物造成堵塞现象，系统投入使用前必须进行冲洗。冲洗无论是对用户采暖系统、外部热力管网、燃气锅炉房管网或燃气锅炉本身都是十分必要的。

为了保证燃气锅炉压力表和安全阀的灵敏可靠，必须对它们定期进行检验和经常检查。还有另一种调节，由于某种原因，燃气锅炉汽压突然变化，这时运行操作人员同样必须及时调节。有时反应出来的情况是相同的，但原因可能是多种多样的，这就要求操作人员依靠多种仪表指示，经过分析和判断，查明真实原因，然后再进行有效的操作，这样才保证燃气锅炉的安全经济运行。

当燃气锅炉蒸发量大于蒸汽负荷时，汽压就上升；当蒸发量小于蒸汽负荷时，汽压就下降。对燃气锅炉汽压的调节也就是蒸发量的调节，而蒸发量的大小又取决于燃气锅炉的燃烧状况，因此汽压的变化反映了燃气锅炉负荷与燃烧之间的平衡关系。强化燃烧时，蒸发量就增大；燃烧减弱时，蒸发量就减少。燃气锅炉压力过高，燃气锅炉各部件承受的内应力增加，容易造成损坏或影响寿命。尤其是汽压过高而燃气锅炉的安全阀又不动作时，极易发生爆炸事故。即使汽压升高引起安全阀动作，会使蒸汽从安全阀逸出，也会造成较大的热损失，且影响安全阀的密闭性能。

燃气锅炉在负荷变化较长时，可能出现虚假水位。因此，在监视和调整水位时，要注意判断暂时假水位，正确掌握虚假水位的调节方法，决不能出现操作失误，给燃气锅炉安全运行造成危害。一般情况下，水位突然升高时，首先应该适当增加燃料，强化燃烧，使蒸发量等于蒸汽流量，恢复汽压；然后等到水位开始下降时，再增加给水量，逐渐恢复水位。同时，要注意监视燃气锅炉给水能力，通过给水泵出口处的压力表，监视供水压力，若出现燃气锅炉的压力差渐渐增大的倾向，应检查给水管路是否产生阻塞障碍等，应查明原因采取措施消除。

燃气锅炉水位计内看不见水位时，应立即检查水位计，或采用“叫水”的方法来判断燃气锅炉缺水或满水的情况。其操作程序及判断处理方法是：先打开水位计下部的放水阀，如有大量水汽喷出并在水位计内出现汽泡上升等现象，则证明燃气锅炉满水（超过最高允许水位，清晰透明的玻璃管内的颜色发暗），应停止通风、燃烧，通过排污阀放水至正常水位，然后即可投入运行。

在不少低温热水采暖系统中，既没有膨胀水箱，又没有定压罐设备，只是利用手动补给水泵保持系统压力。这种方法与热水燃气锅炉应有自动补给水装置和定压措施的要求相违背，增加了汽化和水击的危险，必须予以纠正。

燃气锅炉超温严重会造成过热器、再热器管爆破，对设备安全有很大威胁。汽温过低，蒸汽的焓值降低，汽耗量增加，经济性下降。运行中很多因素会使蒸汽温度发生变化，例如燃气锅炉负荷、过量空气系数、给水温度、受热面的污染情况、燃烧设备的运行方式、燃料种类和成分以及饱和蒸汽用量等，为此在燃气锅炉运行中应采取多种措施来调整蒸汽温度。